Créé en 1977, le Musée de Pontarlier occupe une des plus anciennes demeures de Pontarlier (15e siècle). Le bâtiment a conservé un bel ensemble de vitraux (début 20e siècle) et des poutres ornées de motifs historiés peints (18e siècle).
Il présente des collections liées à l’histoire de Pontarlier, des collections archéologiques (de la Préhistoire au Moyen-Age), des faïences, des peintures comtoises ainsi que la bibliothèque de l’écrivain et grand voyageur Xavier Marnier.Une large place est consacré à l'absinthe.
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